Σύμφωνα με σχετική ανακοίνωση το Μνημόνιο Συνεργασίας έχει στόχο την ενδυνάμωση της συνεργασίας μεταξύ της Γενικής Διεύθυνσης Τελωνείων και ΕΦΚ, και του Λιμενικού Σώματος - Ελληνικής Ακτοφυλακής σε τομείς, που αφορούν στην ανταλλαγή πληροφοριών, την εκπαίδευση, καθώς και το σχεδιασμό και τη διεξαγωγή κοινών επιχειρησιακών δράσεων για αποτελεσματικότερη άσκηση των ελέγχων.

Το Μνημόνιο Συνεργασίας θα συμβάλλει σημαντικά στην ενίσχυση της ασφάλειας, εξασφαλίζοντας ταυτόχρονα την απρόσκοπτη κυκλοφορία των προσώπων, τη διακίνηση των αγαθών και την ομαλή ροή του νόμιμου εμπορίου.