Με βάση τις πρώτες πληροφορίες, δυο άγνωστοι που επέβαιναν σε μια λευκή μοτοσυκλέτα μεγάλου κυβισμού τον «γάζωσαν» με 22 σφαίρες από καλάσνικοφ μέσα στο αυτοκίνητό του στη Λεωφόρο Αθηνών. Σημειώνεται πως ο 48χρονος, οδηγούσε ένα αυτοκίνητο μάρκας ΒΜW και την ώρα του συμβάντος, μιλούσε στο τηλέφωνο. Η δολοφονία έγινε λίγα μέτρα από την μάντρα αυτοκινήτων που διατηρούσε ο Στεφανάκος μαζί με τον αδελφό του.
Το φοβόταν η ΕΛ.ΑΣ.
Η απρόσμενη αποφυλάκιση του Βασίλη Στεφανάκου, ο οποίος έκανε χρήση τη των ευνοϊκών διατάξεων του νόμου Παρασκευόπουλου, είχε προκαλέσει ανησυχία στους επικεφαλής των αστυνομικών αρχών, καθώς ο τότε πρώην κρατούμενος είχε πολλά ανοικτά μέτωπα με άλλες, αλλά αντίπαλες, σκληρές φυσιογνωμίες της ελληνικής μαφίας.
Με το που έγινε πράξη η αποφυλάκισή του Στεφανάκου τον Αύγουστο του 2016, οι αστυνομικοί επισήμαιναν πως έχει αποφυλακιστεί αρκετά σύντομα και πως ο φερόμενος «αρχηγός της Ελευσίνας» είχε ουκ ολίγους «ανοικτούς» λογαριασμούς.
Ποιος ήταν ο Βασίλης Στεφανάκος
Ο Στεφανάκος είχε καταδικασθεί σε κάθειρξη 21 ετών και τριών μηνών για ηθική αυτουργία σε δολοφονία που φέρεται να διέπραξε στις 26 Αυγούστου 2006 ο Αλκέτ Ριζάι σε καφενείο στο Περιστέρι αλλά και για την απόδραση Ριζάι και Παλαιοκώστα από τον Κορυδαλλό πάλι για ηθική αυτουργία. Στον Βασίλη Στεφανάκο, η αστυνομία είχε αποδώσει μεταξύ άλλων αρχηγικό ρόλο στις δραστηριότητες της GreekMafia και «σχέσεις συνεργασίας» με μέλη της Συνωμοσίας Πυρήνων της Φωτιάς, σύμφωνα με αστυνομικές πηγές, αποφυλακίστηκε τον Δεκαπεντάγουστο.
Τα τελευταία χρόνια, πολλές φορές, ο διάσημος έγκλειστος φερόταν από την αστυνομία να έχει «ρόλο» πίσω από εναέριες αποδράσεις, δολοφονίες, ενώ συνδέθηκε από τους αστυνομικούς με τα φυλακισμένα μέλη της Συνωμοσίας Πυρήνων της Φωτιάς, τον Χριστόδουλο Ξηρό και το σχέδιο απόδρασης «Γοργοπόταμος» που περιελάμβανε ανατίναξη της περίφραξης των φυλακών με αυτοσχέδιο «κανόνι».
Οι αξιωματικοί της ΕΛ.ΑΣ., απέδιδαν στον Βασίλη Στεφανάκο «βοήθεια» στις δολοφονίες των δύο μελών της Χρυσής Αυγής στο Ν. Ηράκλειο την 1η Νοεμβρίου 2013 από τις «Μαχόμενες Επαναστατικές Λαϊκές Δυνάμεις» και του 47χρονου αρχιφύλακα των φυλακών Δομοκού Σεραφείμ Γκαλιμάνη στις 21 Φεβρουαρίου 2015 στην Κουβέλα Στυλίδας, την οποία ανέλαβε η «Οργάνωση Πολιτοφυλακής Λαϊκή Δικαιοσύνη», χωρίς όμως να έχουν προς το παρόν στοιχεία που να επιβεβαιώνουν τις εκτιμήσεις τους. Στην κηδεία του άτυχου αρχιφύλακα, ο Βασίλης Στεφανάκος είχε στείλει στεφάνι.