Οι αιτήσεις είναι δύο και αφορούν η πρώτη υπουργική απόφαση που φέρει την υπογραφή της υπουργού Παιδείας και θεσπίζει το εκλογικό σύστημα για την ανάδειξη των μελών των νέων Συμβουλίων Διοίκησης των ΑΕΙ, την λεγόμενη «ταξινομική ψήφο» δεύτερη την υπουργική απόφαση που ρυθμίζει τα σχετικά με την ανάδειξη και την συγκρότηση των οργάνων διοίκησης στα ΑΕΙ.
Κύρια θέση των πρυτάνεων  στη πρώτη αίτηση ακύρωσης είναι οτι ο εκλογικό σύστημα προσβάλει την αρχή της ισοδυναμίας της ψήφου και καθιστά πρακτικά αδύνατο τον έλεγχο των αποτελεσμάτων από την εφορευτική επιτροπή, αφού η εξαγωγή τους μπορεί να γίνει μόνο με την χρήση ειδικού λογισμικού.Ετσι δεν προστατεύεται η μυστικότητα της ψηφοφορίας, ούτε και η δικαστική προστασία των θιγόμενων.
Στη δεύτερη αίτηση Τα πανεπιστήμια ισχυρίζονται ότι οι διατάξεις του Νόμου 4009/2011 που αφορούν τα πανεπιστημιακά όργανα προσβάλουν την συνταγματικώς κατοχυρωμένη αρχή της πλήρους αυτοδιοίκησης των ΑΕΙ αλλά και την ακαδημαϊκή ελευθερία.Να σημειωθεί οτι θα ζητηθεί από τον πρόεδρο του ΣτΕ να εκδικαστεί η υπόθεση λόγω σπουδαιότητας μέσα σε σύντομο χρονικό διάστημα.
Οι δύο κοινές αιτήσεις ακύρωσης έρχονται ως φυσική συνέχεια των κινήσεων της πανεπιστημιακής κοινότητας ενάντια στο νέο νόμο, μετά των μεμωνομένων αιτήσεων ακύρωσης απο ιδρύματα και καθηγητές , αλλα και τις κινητοποιήσεις φοιτητών το προηγούμενο διάστημα