Επί της ουσίας η Ευρωπαϊκή Ένωση επικύρωσε αυτό που ελληνική κυβέρνηση είχε αποφασίσει, δηλαδή τη δημιουργία παραρτήματος στην Αθήνα που έχει πάρει πλέον όλο. 

Έτσι χάνεται οριστικά - παρά τις αρχικές αντιδράσεις από φορείς - για τη Μεγαλόνησο ο ENISA, που είχε φιλοξενηθεί στην Κρήτη, με απόφαση της Κυβέρνησης Σημίτη.