Την έντονη ανησυχία της για τις εξελίξεις εκφράζει η Ιερά Επαρχιακή Σύνοδος της Εκκλησίας της Κρήτης, με αφορμή την συμφωνία του Αλέξη Τσίπρα με τον Αρχιεπίσκοπο Ιερώνυμο για τις σχέσεις Κράτους - Εκκλησίας. Αξίζει να σημειωθεί πως η Εκκλησία της Κρήτης ανήκει στο Οικουμενικό Πατριαρχείο, με τον Πατριάρχη Βαρθολομαίο να εκφράζει επίσης τις επιφυλάξεις του για τη συμφωνία.

Τους προβληματισμούς του Οικουμενικού Πατριάρχη σχετικά με το σχέδιο συμφωνίας Τσίπρα-Ιερώνυμου θα μεταφέρει στην Αθήνα ο υπουργός Παιδείας Κώστας Γαβρόγλου, που συναντήθηκε το Σάββατο με τον Βαρθολομαίο στο Φανάρι.

Επισπεύδονται οι διαδικασίες στην Εκκλησία, προκειμένου να ληφθούν αποφάσεις σχετικά με την προτεινόμενη συμφωνία Τσίπρα-Ιερώνυμου για την εκκλησιαστική περιουσία και το μισθολογικό των κληρικών.

Ποικίλες αντιδράσεις προκάλεσε στους κόλπους της Εκκλησίας η παρουσίαση της πρόθεσης συμφωνίας του Αλέξη Τσίπρα με τον Αρχιεπίσκοπο Ιερώνυμο, ο οποίος προσπαθεί να καθησυχάσει τους κληρικούς.

Επικριτικά σχολιάζει η Φώφη Γεννηματά τη στάση της κυβέρνησης αλλά και της αξιωματικής αντιπολιτευσης στο θέμα των σχέσεων Εκκλησίας-Κράτους.

Ιστορική χαρακτήρισε ο κυβερνητικός εκπρόσωπος, Δημήτρης Τζανακόπουλος, τη συμφωνία για τις σχέσεις Πολιτείας- Εκκλησίας, ενώ παραδέχθηκε πως οι κληρικοί βγαίνουν από το Δημόσιο, αν και θα πληρώνονται από αυτό, για να γίνουν προσλήψεις σε άλλους δημόσιους φορείς.

Δεν καλοδέχθηκε τη συμφωνία Ιερώνυμου-Τσίπρα ο Νίκος Φίλης, καθώς έκανε λόγο για «γαλαντομία του κράτους».