Εμπόδιο στη δημιουργία υδατοδρομίου στην Πάτμο αποτελεί η αρνητική γνωμοδότηση του λιμεναρχείου Πάτμου το οποίο με έγγραφό του προς το υπουργείο Ναυτιλίας γνωμοδοτεί αρνητικά όσον αφορά στη χωροθέτηση υδατοδρομίου στο νησί.