Οπως αναφέρει το έγγραφο για το Εθνικό Πρόγραμμα Μεταρρυθμίσεων, οι μεγαλύτερες προκλήσεις για την ελληνική οικονομία εντοπίζονται στους τομείς των δημοσίων οικονομικών, της απασχόλησης, της Παιδείας και της δια βίου εκπαίδευσης. Ειδικά στο μέτωπο του ελλείμματος, η Κομισιόν κρίνει πως το πρόγραμμα μεταρρυθμίσεων παραμένει ασαφές. Παράλληλα, επισημαίνει την αντίφαση του προγράμματος όσον αφορά τη λήψη διαρθρωτικών μέτρων και τη βαρύτητα των μεμονωμένων ρυθμίσεων. Στο έγγραφο αναφέρεται: «το εθνικό πρόγραμμα μεταρρυθμίσεων προβλέπει λήψη διαρθρωτικών μέτρων τόσο στο σκέλος των δαπανών όσο και στο σκέλος των εσόδων (πάταξη της φοροδιαφυγής, διεύρυνση της φορολογικής βάσης), καθώς και μια σειρά παρεμβάσεις με στόχο τη βελτιστοποίηση της αξιοποίησης παραγωγικών πόρων και της ποιότητας των δημοσίων οικονομικών». Ωστόσο, επισημαίνεται ότι «παρόλα αυτά, η στρατηγική της δημοσιονομικής εξυγίανσης που περιγράφεται στο πρόγραμμα μεταρρυθμίσεων βασίζεται εν μέρει στη λήψη μεμονωμένων μέτρων, όπως η πώληση και επέκταση προνομίων (αεροδρόμιο, δρόμοι, καζίνα). Η επίτευξη του στόχου προϋποθέτει ότι τα στοιχεία του ελλείμματος για το 2004 και τα προηγούμενα έτη δεν θα αναθεωρηθούν προς τα πάνω και ότι οι αυξημένες απαιτήσεις για τις συγχρηματοδοτήσεις των διαρθρωτικών ταμείων θα συνυπολογιστούν με τον κατάλληλο τρόπο». Σύμφωνα με την Επιτροπή, ο στόχος της εξυγίανσης της ελληνικής οικονομίας «αναγνωρίζεται ως πρόκληση», ενώ η υπόθεση του προγράμματος σχετικά με την αναμενόμενη αύξηση των επιπέδων απασχόλησης, κρίνεται ως ιδιαίτερα φιλόδοξη. Η Κομισιόν σημειώνει πως δεν είναι σαφές πώς θα καταστεί δυνατός ο εκσυγχρονισμός των υπηρεσιών εξυπηρέτησης των ανέργων και αντιμετώπισης των συνθηκών που επικρατούν στην αγορά εργασίας. Στο πλαίσιο αυτό, ζητείται να επανεξετασθεί η επίδραση που θα έχει στην αγορά εργασίας το σύστημα φορολογίας και το σύστημα χορήγησης επιδομάτων, καθώς και μεγαλύτερη σαφήνεια των μέτρων και εξαγγελιών για την αντιμετώπιση της ανεργίας των νέων, τη μείωση των διαφορών στους μισθούς με βάση το φύλο και την ενίσχυση της συμμετοχής των εργαζομένων μεγαλύτερης ηλικίας. Επιπλέον, η Κομισιόν ασκεί κριτική και για την έλλειψη στρατηγικής για την αντιμετώπιση του ασφαλιστικού προβλήματος. «Το εθνικό πρόγραμμα μεταρρυθμίσεων δεν παρουσιάζει μια επαρκή στρατηγική για τη μεταρρύθμιση του συστήματος ασφάλισης, ούτως ώστε να ενισχυθούν η επάρκεια και η διατηρησιμότητά του», αναφέρει το έγγραφο. Συνεπώς, προτείνεται η αύξηση των ηλικιακών ορίων συνταξιοδότησης.