Τα δύο ιδρύματα είναι διασυνδεόμενα νοσοκομεία με ενιαία Διοίκηση, ξεχωριστούς οργανισμούς και ξεχωριστούς προϋπολογισμούς και όπως αναφέρει η ΠΟΕΔΗΝ «τα ταμεία τους είναι μείον», με αποτέλεσμα «να αδυνατούν να συντηρήσουν τις υποδομές και τον εξοπλισμό, καθώς και να προμηθευτούν φάρμακα, υγειονομικό και χειρουργικό υλικό» και αναγκάζονται «το ένα δανείζεται από το άλλο, ή από τρίτα νοσοκομεία».

Σύμφωνα με την ΠΟΕΔΗΝ, φέτος τα νοσοκομεία λαμβάνουν κρατική χρηματοδότηση 1.156 δισ. ευρώ από 1,5 δισ. ευρώ που έλαβαν πέρυσι, ενώ οφείλουν σε ληξιπρόθεσμα 1,3 δισ. ευρώ.