Όπως πολύ συγκεκριμένα προβλέπει το αναθεωρημένο Μνημόνιο, σύμφωνα με το σχέδιο, ο φόρος θα επιστρέφεται χωρίς έλεγχο εντός μιας εβδομάδας σε όσες επιχειρήσεις δεν έχουν ληξιπρόθεσμες οφειλές, είναι συνεπείς στην απόδοση του φόρου και δεν έχουν υποπέσει σε φορολογικές παραβάσεις την τελευταία διετία. Αντίθετα όσες επιχειρήσεις έχουν διαπράξει φορολγοικές παραβάσεις θα περιμένουν μέχρι να ολοκληρωθεί ο έλεγχος των στοιχείων που έχουν υποβάλει.
Ειδικότερα το νέο πλαίσιο για τον ΦΠΑ προβλέπει:

• Eλάχιστο όριο για την εγγραφή μικρών επιχειρήσεων σε καθεστώς ΦΠΑ. Υπάρχουν εισηγήσεις το ποσό να είναι χαμηλότερο των 20.000 έως 25.000 ευρώ. Να σημειωθεί ότι σήμερα περίπου το 42% των φορολογουμένων στο σύστημα ΦΠΑ είναι μικρές επιχειρήσεις που αποφέρουν αρνητικά έσοδα περίπου 2,3% σε υποχρεώσεις ΦΠΑ.
• Δημιουργία ειδικής μονάδας για την παρακολούθηση των συνολικών επιδόσεων του ΦΠΑ.
• Εκκαθάριση του μητρώου ΦΠΑ από τις ανενεργές επιχειρήσεις.
• Δημιουργία μονάδας με αρμοδιότητα τον εντοπισμό περιπτώσεων απάτης ΦΠΑ και συντονισμό δραστηριοτήτων πρόληψής τους.
• Δημιουργία ενός αυτοματοποιημένου συστήματος επικύρωσης για την επιστροφή ΦΠΑ που βασίζεται σε πραμέτρους κινδύνου (risk-based).
• Κατάργηση της εκκαθαριστικής δήλωσης.