Η Επιτροπή απέστειλε επίσης προειδοποιητικές επιστολές στην Ιταλία και την Ελλάδα γιατί παρέλειψαν να υποβάλουν περιβαλλοντικές μελέτες για τη σημερινή κατάσταση των υδατικών πόρων τους. Η οδηγία πλαίσιο για τα ύδατα, ακρογωνιαίος λίθος της πολιτικής της ΕΕ στον τομέα των υδάτων, καθορίζει ένα ευρωπαϊκό πλαίσιο για την προστασία όλων των υδατικών συγκροτημάτων στην Ευρωπαϊκή Ένωση – ποταμών, λιμνών, παράκτιων και υπόγειων υδάτων. Στοχεύει στο να είναι όλοι οι υδάτινοι πόροι καλής ποιότητας μέχρι το 2015. Αυτό θα επιτευχθεί μέσω μείωσης της ρύπανσης και της από κοινού διαχείρισης των υδάτινων πόρων κάθε λεκάνης απορροής ποταμού. Η οδηγία απαιτεί να προσδιορίσουν τα κράτη μέλη περιοχές λεκανών απορροής ποταμών, οι οποίες μπορεί να περιλαμβάνουν διάφορες μεμονωμένες λεκάνες απορροής, υδροφόρους ορίζοντες και παράκτια ύδατα. Αυτές οι μονάδες διαχείρισης πρέπει να αποτελέσουν τη βάση σειράς μέτρων, που περιλαμβάνουν αναλύσεις και εκθέσεις σχετικά με τις συνθήκες που επικρατούν σε αυτά τα υδατικά συγκροτήματα. Η οδηγία πλαίσιο για τα ύδατα λειτουργεί με σαφείς προθεσμίες όσον αφορά τα διάφορα στάδια που απαιτούνται για να επιτευχθεί η αειφόρος διαχείριση των υδάτων στην Ευρώπη, και όπου κάθε στάδιο στηρίζεται στο προηγούμενο. Μέχρι τις 22 Ιουνίου 2004 το αργότερο, τα κράτη μέλη όφειλαν να ορίσουν περιοχές λεκανών απορροής ποταμών και να κοινοποιήσουν στην Επιτροπή λεπτομερείς πληροφορίες για τις αρχές στις οποίες ανέθεσαν την διαχείρισή τους. Η Ιταλία, η Ισπανία και η Ελλάδα δεν έχουν ακόμη υποβάλει όλες τις απαιτούμενες πληροφορίες και έτσι τους απεστάλη τελική γραπτή προειδοποίηση. Σε περίπτωση που δεν απαντήσουν ικανοποιητικά, η Επιτροπή μπορεί να αποφασίσει να προσφύγει ενώπιον του Δικαστηρίου της Ευρωπαϊκής Ένωσης.