Το ΕΙΤ θα έχει ως πρωταρχικό του στόχο "τη συμβολή στην ανάπτυξη της ικανότητας της Κοινότητας και των κρατών μελών στην καινοτομία περιλαμβάνοντας στην προσπάθεια αυτή τις δραστηριότητες εκπαίδευσης, έρευνας και καινοτομίας κατά τα υψηλότερα δυνατά πρότυπα", τονίζεται στην κοινή θέση του Συμβουλίου.

Επιπλέον, το ΕΙΤ θα δώσει προτεραιότητα στη μεταφορά των δραστηριοτήτων του σχετικά με την τριτοβάθμια εκπαίδευση, την καινοτομία και την έρευνα προς το επιχειρηματικό πεδίο και την εμπορική χρήση τους, καθώς και στην υποστήριξη της δημιουργίας νεοσύστατων επιχειρήσεων, θυγατρικών επιχειρήσεων και μικρομεσαίων επιχειρήσεων.

Το ΕΙΤ θα λειτουργήσει μέσω αξιοκρατικών, αυτόνομων εταιρικών συμπράξεων με ιδρύματα τριτοβάθμιας εκπαίδευσης, ερευνητικούς οργανισμούς, επιχειρήσεις και άλλους ενδιαφερόμενους φορείς υπό τη μορφή βιώσιμων και μακροπρόθεσμα αυτοδύναμων στρατηγικών δικτύων. Οι εταιρικές αυτές συμπράξεις θα επιλέγονται από το διοικητικό συμβούλιο του ΕΙΤ βάσει διαφανούς διαδικασίας για την επιλογή των άριστων και θα ορίζονται ως Κοινότητες Γνώσης και Καινοτομίας.