Ο ανάδοχος ΕΦΔ θα διαχειριστεί κατά την περίοδο 2007- 2013 δράσεις εκτιμώμενου προϋπολογισμού 1,8 δισ ευρώ, για την προώθηση της επιχειρηματικότητας των επιχειρήσεων, και, κυρίως, των μικρομεσαίων.

Η προκήρυξη του ΕΦΔ για το ΕΠΑΝ ΙΙ εμφανίζει αρκετές καινοτομίες, σημαντικές τόσο για την εύρυθμη και διαφανή λειτουργία του Προγράμματος, όσο και για τη διευκόλυνση των δικαιούχων στις διαδικασίες υποβολής των προτάσεων.

Πιο συγκεκριμένα, για πρώτη φορά, θα προσληφθεί ένας ενιαίος ΕΦΔ, έναντι οκτώ που λειτουργούσαν στο Επιχειρησιακό Πρόγραμμα «Ανταγωνιστικότητα» (ΕΠΑΝ).

Προβλέπεται η ηλεκτρονική διενέργεια του συνόλου των διαδικασιών υλοποίησης επενδυτικών προτάσεων (υποβολή, αξιολόγηση, έλεγχος, εκταμίευση) και η δημιουργία Ολοκληρωμένου Πληροφοριακού Συστήματος.

Αναμορφώνεται η διαδικασία αξιολόγησης μέσω της δημιουργίας μητρώου ανεξάρτητων αξιολογητών.

Επιταχύνονται δραστικά οι εκταμιεύσεις των επιχορηγήσεων στους δικαιούχους, μέσω της διαδικασίας προχρηματοδότησης με χρήση του πιστωτικού συστήματος.

Δικαίωμα συμμετοχής στη διαδικασία ανάθεσης έχουν νομικά πρόσωπα του ιδιωτικού τομέα μη κερδοσκοπικού χαρακτήρα και ενώσεις νομικών προσώπων που σε περίπτωση επιλογής θα συστήσουν νομικό πρόσωπο μη κερδοσκοπικού χαρακτήρα. Με σκοπό την διευκόλυνση των επενδυτών, προβλέπεται η ενεργός συμμετοχή χρηματοπιστωτικών ιδρυμάτων, για την αύξηση των σημείων πληροφόρησης και υποβολής προτάσεων.