Αιχμές κατά του Γιάννη Αγγέλου άφησε ο πρώην υφυπουργός Πέτρος Δούκας για την υπόθεση της Μονής Βατοπεδίου, τονίζοντας ότι το Μέγαρο Μαξίμου "γνώριζε από την αρχή όλη την υπόθεση".

Το πρώτο τηλεφώνημα που πήρα για την υπόθεση Βατοπαδίου ήταν το Ιούνιο του 2004 από τον κ. Γιάννη Αγγέλου, είπε μεταξύ άλλων στην επιτροπή της Βουλής που εξετάζει το σκάνδαλο του Βατοπεδίου ο πρώην Υφυπουργός Οικονομικών κ. Πέτρος Δούκας. Σύμφωνα με πληροφορίες ο κ. Δούκας είπε ότι ο κ. Αγγέλου του ζήτησε να δώσει προτεραιότητα στην εξέταση και προώθηση των εγγράφων του Νομικού Συμβουλίου του Κράτους. Τότε έμαθα για πρώτη φορά στη ζωή ότι υπήρχε υπόθεση Βατοπεδίου, φέρεται να είπε στην επιτροπή ο κ. Δούκας σύμφωνα με τις ίδιες πηγές.

Με ομόφωνη απόφαση, η Ολομέλεια της Βουλής αποφάσισε λίγο μετά τα μεσάνυχτα της Δευτέρας τη σύσταση νέας Εξεταστικής Επιτροπής για τη διερεύνηση του συνόλου της υπόθεσης της Μονής Βατοπεδίου.