Ο Πρόεδρος της Επιτροπής Κεφαλαιαγοράς δεν είναι υπάλληλος του Υπουργείου Οικονομίας. Η Επιτροπή Κεφαλαιαγοράς λειτουργεί με τα χρήματα των εποπτευομένων, δηλαδή με τις εισφορές που πληρώνουν οι εισηγμένες στο χρηματιστήριο εταιρείες όπως και όλοι οι υπόλοιποι φορείς που ελέγχονται από την ΕΚ.