Η Seanergy Maritime Holdings Corp.,μέσω της θυγατρικής της εταιρείας Seanergy Shipmanagement Corp., είναι η μοναδική ελληνική ναυτιλιακή εταιρεία που συμμετέχει στο πρόγραμμα SAFeCRAFT («Safecraft»). Το πρόγραμμα χρηματοδοτείται από την Ευρωπαϊκή Ένωση και αποτελεί μια πρωτοποριακή δράση για τη χρήση εναλλακτικών καυσίμων στη ναυτιλία.